在不远的将来，世界被智脑公司掌控。多数人类被该公司变成怪人“俄尔以诺”，仅剩下2433名人类组成反抗军，以女主角园田真理为核心，在角落里艰难求生。 假面骑士555是人类的希望，其变身者乾巧在智脑公司的总攻中战败，如今生死未卜。为了对付剩余的假面骑士凯撒，智脑公司研发出最强的假面骑士腰带“帝王腰带”。变身后的邪恶假面骑士实力强大，反抗军根本无力抵抗。人类难道真的要走向灭绝吗？ 心灰意冷的园田真理在空荡的舞会上暗自落泪，这时，一个身着白衣的男子出现在她身后。真理从他身上仿佛看到了乾巧的模样，原来他正是失去记忆的乾巧。 巧和真理在这孤寂世界中的命运将会如何？人类的救世主传说就此拉开帷幕！