故事舞台设定在能自由进行时间移动的未来日本，电视台的新手制作人，为制作综艺节目前往江户时代。在那里，他发掘了冒失的三人组合，将他们打造成为“超忍者队イナズマ！”。然而，真正的魔物突然现身……