明嘉靖46年，奸相严嵩倒台，一代清官海瑞沉冤得雪，被任命为兴国县令。在任期间，他体恤民情，巧妙断案，政绩显著，深受百姓的爱戴。当时，嘉靖皇帝沉迷于道教，疏于朝政，百姓生活困苦，怨声不断。海瑞仗义执言，力劝皇帝，详细陈述利弊，严厉斥责嘉靖为政不力，因此招来杀身之祸。后来新君继位，海瑞虽免一死，却遭遇丧子之痛，还饱受牢狱之灾。之后，他升任应天巡抚，全力治理江河，扬善除恶，为百姓做主，刚正不阿，名满天下，威震四方，深受民众爱戴。该剧历史资料详实，故事情节跌宕起伏，将一代清官的光辉形象刻画得淋漓尽致。该剧分为廉泉斗贪、巧断孽缘、海瑞骂君、生死牌、龙王治江、九州思公等多个单元。