战争以奇兵队为首的各队取得压倒性胜利而告终。长州藩借此契机，摒弃了原先对幕府恭顺的态度，转而举藩倒幕。三年后，自镰仓时代起延续了七百多年的武家社会彻底崩塌。奇兵队四处转战，于明治3年以编入政府常备军的形式解散。吉田松阴在松下村塾任教两年多，这期间的门生人数推测约为92人。其中，像伊藤博文、山县有朋这对双璧一样，在明治以后担任政府高官并留名青史的有22人。不过，也有不少人对新政府感到不满。此外，有20人没能等到明治维新，在之前的战役中不幸殒命。高杉晋作在明治维新前一年于下关病逝，年仅28岁，据说有三千人为他送葬。吉田松阴享年29岁，《金银岛》的作者、英国人罗伯特·斯蒂文森评价他为“人类史上最高洁的人”。