变种人小淘气因自身特殊能力险些害死亲近之人，于是选择自我放逐。旅途中，她偶遇失忆的金刚狼，还遭到未知变种人的攻击，关键时刻得到X教授领导的X战警救助，并获安排住处。原来，袭击他们的是万磁王领导的变种人兄弟会成员。兄弟会设计了一种能让普通人基因突变为变种人的装置，要实现该计划需借助万磁王的能力。为达目的，万磁王袭击X战警并绑架小淘气，企图利用她的能力复制自己的能力来操作机器。为阻止万磁王的阴谋并救回小淘气，金刚狼加入X战警，与邪恶的变种人兄弟会展开决战。 这些变种人天生带有突变基因，拥有超乎想象的力量。镭射眼两眼能发射红色光线，可在山体上打出洞；琴·格雷擅长隔空移物和心灵感应；暴风女能控制天气，呼风唤雨。在人类主宰的世界里，他们被视为怪物，很多人害怕、厌恶并拒绝接受他们，一心想将他们驱逐。参议员罗伯特·凯利就是这样的“诽谤者”，这位职业政客想通过立法揭露这些“危险”的变种人。