有一天，丹他们居住的城市“罗斯沃尔摩斯”突然遭遇各种灾害，巨大的植物怪物现身、地面突然喷出火焰、洪水泛滥等。似乎是行星“维斯托里亚”的6种属性的元素能量失控，蔓延到了地球。丹和奥萨姆·万的成员们意识到这样下去地球会很危险，于是进入了对元素能量颇有研究的校长浮士德运营的学校——“爆丸学院”。在爆丸学院，他们可以学习利用元素能量让爆丸进一步提升力量的训练方法、爆丸战斗所需的作战策略课程，还有提升战斗者体力的训练等与爆丸相关的一切知识。通过与个性十足的同学和教师们的相遇与交流，他们在战斗者层面和个人层面……