故事发生在德川第十代将军家治执政时期，幕府老中田沼意次手握重权，社会局势动荡不安。此时，江户民间悄然兴起了一种名为“黑暗猎人”的职业，他们受雇暗杀雇主的对手，导致暗杀事件频发，让仇家众多的人整日惶恐不安。五名清又兵卫表面上是继承祖业的本分商人，实际上却是黑暗猎人的统领。某晚，独眼浪人谷川弥太郎杀死了敌对帮派的领袖德藏，随后成为了五名的保镖。他的到来，在原本就暗潮涌动的杀手世界里掀起了一场血雨腥风。